法律分析：存疑不起诉说明行为人并未被定罪，也就是无罪之人，自然没有案底的。案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录。
法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百四十条 对于补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足的，不符合起诉条件的，可以做出不起诉的决定。